Đại Tần Đế Quốc Khởi Nguyên xoay quanh câu chuyện Tần Văn Công Doanh Thạc lên ngôi trong thời điểm đất nước bị tàn phá, sau khi phụ vương của ông tuẫn quốc. Triều đình bị xé nát bởi tranh cãi về việc dời đô, mối quan hệ giữa anh em ruột thịt trở nên căng thẳng và lạnh nhạt, thậm chí dẫn đến tình cảnh gươm tuốt trần.
Trong bối cảnh đó, Tần Văn Công Doanh Thạc đã thực hiện nhiều bước đi quan trọng để vực dậy đất nước. Ông ban hành luật, rèn binh khí, và thu nạp những tàn dư của nhà Chu. Đồng thời, ông sử dụng hôn nhân như một công cụ để phá vỡ cục diện chính trị bế tắc.
Sau mười sáu năm không ngừng mở rộng lãnh thổ và mài sắc gươm kiếm, Tần Văn Công Doanh Thạc đã đưa Tần từ một bộ lạc man di ở biên giới phía Tây vươn lên trở thành một thế lực được các nước kính nể. Thành công của ông đã đặt nền móng vững chắc cho sự quật khởi của Đại Tần sau này.