Hậu Cung Như Ý Truyện xoay quanh câu chuyện về cuộc đời của Như Ý, một cô gái trẻ xinh đẹp và thông minh, người đã trở thành phi tử của Hoàng Đế Càn Long. Khi Càn Long lên ngôi, Như Ý – người bạn thời thiếu niên của ông cũng tiến cung và nhanh chóng được sủng ái, trở thành Nhàn Phi.
Tuy nhiên, sự thăng tiến nhanh chóng của Như Ý khiến nhiều người ghen ghét và muốn lật đổ. Thêm vào đó, mối quan hệ giữa Thái Hậu và Như Ý có mối thù gia tộc, khiến Như Ý bị công kích tứ phía. Trong bối cảnh đó, Càn Long cũng phải đối diện với vấn đề tranh giành quyền lực của Thái Hậu.
Trong quá trình thay đổi quyền lực, Càn Long và Như Ý hỗ trợ lẫn nhau, cùng nhau vượt qua hoạn nạn và xóa hết những trở ngại. Sau nhiều năm vất vả, sát cánh bên nhau, Càn Long muốn đưa Như Ý lên vị trí Hoàng Hậu, cùng nhau chia sẻ ngọt bùi.
Tuy nhiên, khi trở thành Hoàng Hậu, Như Ý phát hiện ra sự thay đổi đáng ngờ và sự ích kỷ của Càn Long, khiến sự tin tưởng và tình cảm giữa hai người dần dần tan vỡ. Dù vậy, Như Ý vẫn giữ những kỷ niệm đẹp và trách nhiệm của một Hoàng Hậu cho đến khi qua đời.