Heesu In Class 2 xoay quanh câu chuyện về Heesu, một chàng trai đang che giấu tình cảm của mình dành cho người bạn thân nhất. Mối quan hệ giữa họ vẫn luôn tốt đẹp, cho đến khi người bạn thân ấy bắt đầu để mắt đến một người khác.
Heesu buộc phải đối mặt với sự thật rằng người bạn thân của mình đã chuyển sự quan tâm của mình sang người khác. Điều này khiến Heesu cảm thấy đau khổ và tổn thương. Sự im lặng và che giấu tình cảm của Heesu bắt đầu gây ra những ảnh hưởng tiêu cực.
Khi tình cảm và sự im lặng trở thành gánh nặng, Heesu phải tìm cách đối mặt với thực tại và những cảm xúc của mình. Liệu Heesu có thể tìm được cách để thể hiện tình cảm của mình, hay sự im lặng sẽ tiếp tục làm tổn thương anh?