Năm Ngón Tay Diệu Kỳ xoay quanh cuộc đời của Song Woo Yeon, một nữ sinh trung học nhút nhát và sống khép kín. Cô không rõ mục đích sống của mình là gì và gặp khó khăn trong việc thể hiện cảm xúc.
Cuộc đời Woo Yeon thay đổi khi cô được mời làm người mẫu cho câu lạc bộ vẽ “Spirit Fingers”. Tại đây, cô gặp những con người chân thành và cởi mở, trong đó có phó chủ tịch Nam Geu Rin, người đã khích lệ Woo Yeon gia nhập câu lạc bộ.
Woo Yeon nhanh chóng kết bạn với Nam Ki Jeong, em trai của Geu Rin, một người mẫu có ngoại hình nổi bật nhưng đang bối rối về giá trị bản thân. Ki Jeong bắt đầu nuôi dưỡng những giấc mơ và cảm xúc mới mẻ về tình yêu khi gặp Woo Yeon.
Qua những trải nghiệm tại câu lạc bộ, Woo Yeon học cách mở lòng và khám phá những cảm xúc mới trong cuộc sống. Cô dần tìm thấy sự tự tin và thoải mái khi ở bên những người bạn mới.