Nhân Viên Điều Tra (Phần 2) xoay quanh cuộc sống của đội điều tra, nơi mà mỗi thành viên đều mang trong mình những câu chuyện đời riêng. Sau cái chết của Liên trong một tai nạn giao thông, Tống không khỏi đau lòng. Sự ra đi của đồng nghiệp đã để lại nhiều tiếc nuối và buộc anh phải đối mặt với nhiều cảm xúc phức tạp.
Đội điều tra chào đón một cấp trên mới, Luật, người có phong cách làm việc khác biệt và dường như không mấy hợp nhau với Tống. Ngoài công việc, cả hai đều để ý đến Phương, một hướng dẫn viên du lịch xinh đẹp. Tuy nhiên, Luật đã có vợ và cuộc hôn nhân của anh không mấy hạnh phúc. Điều này tạo ra nhiều tình huống phức tạp trong mối quan hệ giữa các nhân vật.
Không chỉ Tống và Luật, mà còn Thái và Tuệ, em gái của Tống, cũng trải qua những mâu thuẫn trong cuộc sống hôn nhân. Mặc dù mỗi người đều có những vấn đề riêng, họ vẫn cố gắng hết sức mình để bảo vệ trật tự và an ninh cho Hong Kong. Trong môi trường làm việc đầy thách thức, họ học cách vượt qua những khó khăn cá nhân để hoàn thành nhiệm vụ.