Đại Tam Nguyên xoay quanh câu chuyện về một linh mục trẻ tên Hồng, người đã giúp đỡ Bạch Tuyết Hoa – một cô gái điếm trốn nợ. Cô gái này đã tìm đến nhà thờ để được cứu giúp. Hồng đã giả vờ chuyển đến nơi ở thuê của Bạch để hỗ trợ cô.
Cùng lúc đó, CID Lưu Thanh Phát đang điều tra băng nhóm mại dâm mà Bạch thuộc về. Anh theo dõi Bạch, nhưng việc Hồng can thiệp vào cuộc sống của cô đã khiến mọi thứ trở nên phức tạp. Hồng đã giúp Bạch tìm công việc mới và trau dồi niềm đam mê âm nhạc của cô.
Tuy nhiên, sự kiên trì điều tra của Lưu Thanh Phát và nỗ lực giúp đỡ của Hồng đã dẫn đến nhiều hiểu lầm. Mối quan hệ giữa Hồng, Bạch và Lưu Thanh Phát ngày càng trở nên rối rối. Liệu Hồng có thể giúp Bạch tìm lại con đường đúng đắn, hay việc can thiệp của anh sẽ khiến mọi thứ trở nên tồi tệ hơn?