“Điểm Đen” xoay quanh câu chuyện về một bệnh viện bị đánh bom ở Thổ Nhĩ Kỳ, khiến hàng trăm người thương vong, trong số đó có chồng của bác sĩ và con gái nhỏ của nhà phân tích CIA Abigail “Abby” Trent. Nỗi đau của Abby biến thành lời kêu gọi hành động, và cô quyết tâm chọc tức sếp của mình ở Langley để được giao nhiệm vụ thực địa.
Abby được giao nhiệm vụ tại “The Citadel”, một boongke giám sát và cơ sở điều hành đặc biệt nằm dưới một tảng đá ở sa mạc Jordan. Tại đây, cô đào sâu vào việc phân tích dữ liệu, thẩm vấn những người bị giam giữ và dần khám phá ra mối liên hệ giữa vụ đánh bom bệnh viện và một nhà điều hành quốc tế khét tiếng, được gọi là “Hatchet”.
Khi điều tra sâu hơn, Abby bắt đầu hé mở những bí mật và sự thật đằng sau vụ tấn công. Với sự hỗ trợ từ các nguồn lực của CIA và sự quyết tâm của bản thân, cô nỗ lực ngăn chặn những kẻ khủng bố và đưa chúng ra trước công lý.