Hoàng Đế Chuyên Chế xoay quanh câu chuyện về vị vua Yeonsangun, người lên ngôi khi mới 18 tuổi. Không biết rằng mẹ mình đã bị các đại thần đầu độc, ông bắt đầu thời kỳ trị vì chuyên quyền và tàn bạo.
Trong 11 năm lên ngôi, Yeonsangun đã cho thực hiện hai cuộc thanh trừng dã man nhằm vào các nho sĩ. Không chỉ vậy, ông còn ra lệnh cống nạp một vạn cô gái trẻ và ngựa để phục vụ cho nhu cầu giải trí riêng tư của mình.
Sự tàn bạo của Yeonsangun còn thể hiện qua việc tuyển hàng ngàn cô gái vào cung để làm tam cung lục viện, thỏa mãn dục vọng của ông. Những hành động này đã khiến ông trở thành vị vua tàn bạo nhất trong lịch sử Hàn Quốc. Bộ phim tái hiện lại hình ảnh của vị vua chuyên chế và bạo虐 này.