Lupin Đệ Tam và Thám Tử Lừng Danh Conan là một cuộc đối đầu thú vị giữa hai nhân vật huyền thoại trong thế giới hoạt hình Nhật Bản. Câu chuyện bắt đầu khi Conan Edogawa nhận nhiệm vụ truy bắt Lupin Đệ Tam, kẻ bị tình nghi đánh cắp viên ngọc quý có tên Cherry Sapphire.
Lupin Đệ Tam, với danh tiếng là một tên trộm tinh xảo, luôn một bước ahead của pháp luật. Trong khi đó, Conan Edogawa, với trí thông minh và khả năng suy luận sắc bén, quyết tâm bắt giữ Lupin và đưa hắn ra trước công lý.
Cuộc truy đuổi bắt đầu và hai nhân vật chính liên tục đối đầu trong một loạt các tình huống thú vị và đầy bất ngờ. Liệu Conan có thể bắt được Lupin hay hắn sẽ tiếp tục thoát khỏi lưới pháp luật?
Đây là phần tiếp theo của chương trình truyền hình đặc biệt Lupin đệ tam vs. Thám tử lừng danh Conan cách đây 4 năm.