Naruto Shippuden Movie 3: Người Kế Thừa Hỏa Chí xoay quanh nguy cơ nổ ra Đại chiến Ninja lần thứ 4 khi các ninja có huyết kế giới hạn ở nhiều làng bỗng nhiên biến mất. Sự việc này khiến các quốc gia nghi ngờ làng lá – nơi duy nhất không bị ảnh hưởng – đã gây ra tai nạn.
Các quốc gia tung tin đồn về việc Konoha đang có kế hoạch tạo phản và điều động quân đội đến biên giới Hỏa Quốc, chuẩn bị phát động tấn công. Làng lá buộc phải chứng minh sự trong sạch của mình bằng cách tìm ra nguyên nhân vụ việc.
Nếu không tìm được lời giải, Hỏa Quốc sẽ phải xóa sổ làng lá để giữ hòa bình thế giới. Đây là nhiệm vụ cấp bách và nặng nề đối với những người đứng đầu Hỏa Quốc.