Thần Bếp Tiên Y xoay quanh câu chuyện về một đầu bếp trẻ tuổi có tên là Phúc. Phúc không chỉ có tài nấu ăn ngon mà còn sở hữu một khả năng đặc biệt – có thể nhìn thấy và giao tiếp với các vị thần. Một ngày nọ, Phúc tình cờ gặp một vị thần đang bị đày đọa trên trần gian.
Vị thần này có nhiệm vụ ban đầu là tìm kiếm một người kế thừa để truyền lại chiếc áo choàng thần thánh của mình. Sau khi gặp Phúc, vị thần nhận thấy người trẻ tuổi này có tiềm năng và quyết định chọn Phúc làm người kế thừa.
Tuy nhiên, việc trở thành người kế thừa của vị thần không hề đơn giản. Phúc phải đối mặt với nhiều thử thách và nguy hiểm khi thực hiện các nhiệm vụ được giao. Bên cạnh đó, anh còn phải tìm cách cân bằng giữa cuộc sống thường nhật và nhiệm vụ của một người có khả năng đặc biệt.
Trong hành trình của mình, Phúc gặp gỡ nhiều người bạn và cùng họ trải qua nhiều tình huống thú vị. Tình cảm và sự giúp đỡ từ những người xung quanh đóng vai trò quan trọng, giúp Phúc hoàn thành nhiệm vụ và trưởng thành hơn.