Thủy Quái Hồ Nhị Long xoay quanh sự kiện quân Nhật xâm chiếm vùng Đông Bắc trong Thế chiến thứ hai. Họ nhiều lần cử một đội quân bí ẩn tiến vào hang động khổng lồ gần khu vực Tích Tháp Chủy Tử, nơi được truyền thuyết có chứa một kho báu khổng lồ.
65 năm sau, một tỷ phú Nhật Bản đến hồ Nhị Long để đầu tư xây dựng nhà máy. Không ngờ, sự việc này vô tình đánh thức một quái vật dưới nước, khiến hồ Nhị Long trở thành tâm điểm chú ý của cả nước.
Từ đây, một loạt câu chuyện hài hước xoay quanh con thủy quái kỳ bí bắt đầu mở ra. Sự xuất hiện của quái vật dưới nước đã mang lại nhiều điều bất ngờ và thú vị.