Tổ Chức Khủng Bố xoay quanh loạt vụ cướp ngân hàng và trộm xe gia tăng ở vùng Tây Bắc Thái Bình Dương. Các tội ác này ban đầu được cho là do những tên cướp thông thường với mục đích làm giàu cho bản thân.
Tuy nhiên, một nhân viên FBI lại có góc nhìn khác. Anh ta nghi ngờ rằng những tội ác này không phải do những kẻ cướp thông thường gây ra, mà là của một nhóm khủng bố nguy hiểm.
Nhóm này được cho là có một kẻ cầm đầu tàn nhẫn, đang lên kế hoạch tuyên chiến với chính phủ Mỹ. Những diễn biến tội ác này đã khiến người dân sống trong sợ hãi.
Câu chuyện trong phim là một phần dựa trên sự kiện có thật từng gây chấn động ở Mỹ.