Bất Thường Tại Trường Phép Thuật (Phần 3) tiếp tục hành trình của hai anh em Tatsuya và Miyuki khi họ ghi danh vào Trường trung học Pháp thuật. Tại đây, sự xuất sắc của Miyuki trong hệ danh dự đã tạo ra một khoảng cách giữa cô và người anh trai Tatsuya, người không thể đạt được thành tích tương tự.
Miyuki tỏa sáng trong môi trường học tập nghiêm ngặt, trong khi Tatsuya phải đối mặt với những khó khăn của mình. Sự chênh lệch về thành tích và sự kỳ vọng đã tạo ra một tình huống phức tạp trong mối quan hệ giữa hai anh em.
Trong bối cảnh này, Tatsuya và Miyuki phải điều hướng cuộc sống học tập và những bí ẩn tại Trường trung học Pháp thuật. Những thử thách và khám phá mới sẽ kiểm tra tình anh em và khả năng của họ.