Chẳng Thể Lý Giải Nổi Aharen-san (Phần 2) là câu chuyện tiếp nối về cuộc sống của Aharen-san, một cô nữ sinh vụng về trong giao tiếp xã hội. Cô gặp khó khăn trong việc giữ khoảng cách cá nhân với bạn bè, lúc thì quá gần, lúc lại quá xa.
Một ngày nọ, Aharen-san đánh rơi chiếc gôm và may mắn gặp được Raido, cậu bạn cùng lớp nhặt giúp cô chiếc gôm đó. Ngay lập tức, cô xem họ là bạn thân và từ đó, hai người gắn bó với nhau mọi lúc mọi nơi.
Họ cùng nhau học bài, chơi game, ăn trưa và chia sẻ những khoảnh khắc đời thường. Mối quan hệ ngẫu nhiên này dần nở hoa, chứng minh rằng tình cảm có thể bắt đầu từ những khoảnh khắc bất ngờ nhất.
Phần 2 của series hứa hẹn sẽ mang đến nhiều tình huống hài hước, cảm động và những bài học về tình bạn và tình yêu trong môi trường học đường.