Tiểu Tiên Chi Dao xoay quanh câu chuyện giữa cơn gió lạnh thổi qua chín tầng trời, nữ chúa của Ẩn tộc – Hòa Uyển, đã dẫn quân xâm lấn Thiên Đình. Tam giới kinh hãi trước sự kiện này.
Nam Trạch, vị thượng thần uy dũng, không nao núng mà đứng lên nghênh chiến. Ngu Chi Dao, một tiên nữ chăm sóc ngọc lan giản dị, đã liều mình bảo vệ ngài. Trong thời khắc định mệnh, Nam Trạch và Hòa Uyển cùng sinh cộng tử, nhưng Chi Dao đã bất ngờ chết đi.
Tuy nhiên, nàng tiên nữ này đã được gửi trở lại, và một phép lạ đã xảy ra khi sự tái sinh này đưa cô cộng sinh trong nhục thể của Hòa Uyển. Sức mạnh Ẩn tộc trong cô gần như tan biến.
Từ đó, Chi Dao sống hai cuộc đời: trước bá tánh, cô giữ vẻ uy nghiêm của bậc tôn chủ, nhưng bên người thân thiết, cô hóa thành thiếu nữ nhu mì, nết na. Thính Chiêu, một ẩn vệ từ vùng biển Tây Hải, xuất hiện để hỗ trợ nữ chúa của mình lấy lại thần lực.