Tình Thâm Mấy Phần xoay quanh câu chuyện của Trần Thanh Ngôn, một nữ y sư tại trấn Vân Thủy, và chàng trai mất trí nhớ với số phận éo le mà cô tình cờ cứu được. Trong hành trình cùng nhau chữa lành vết thương lòng, họ dần phát triển tình cảm sâu sắc. Tuy nhiên, Trần Thanh Ngôn không biết rằng chàng trai hiền lành ngày ngày giúp đỡ cô chính là Lạnh Tư Niên, vị thiếu soái lạnh lùng nổi tiếng với tham vọng kiểm soát trấn nhỏ này.
Khi sống cùng Trần Thanh Ngôn, Lạnh Tư Niên đã quên đi những mưu tính quyền lực, chỉ đắm chìm trong sự dịu dàng và bình yên mà cô mang lại. Anh muốn âm thầm bảo vệ cô và cả thị trấn, nhưng kế hoạch này bị phá hỏng khi em trai đầy tham vọng của anh, Lạnh Tử Xuyên, hãm hại và khiến anh trở thành kẻ bị đổ oan gây ra cái chết của ông nội Trần.
Trần Thanh Ngôn căm hận Lạnh Tư Niên và chính bản thân vì đã yêu anh quá sâu. Cô muốn chấm dứt mối tình này, nhưng Lạnh Tư Niên lại không đồng ý và nhốt cô trong dinh thự của mình. Họ liên tục giằng co giữa tình yêu và thù hận, đẩy nhau ra xa nhưng lại không ngừng bị cuốn vào nhau, rơi vào vòng xoáy đầy giằng xé của tình yêu và thù hận.