Cuộc Hẹn Sống Còn (Phần 2) xoay quanh câu chuyện của Itsuka Shidou, một học sinh trung học bình thường. Trong ngày đầu tiên đi học trở lại sau kỳ nghỉ xuân, một đợt không gian chấn đã giáng xuống thành phố. Shidou đi tìm em gái mình trong thiên tai và gặp gỡ một cô gái cầm trọng kiếm sau một cơn không gian chấn.
Em gái của Shidou, Kotori, tiết lộ rằng cô gái đó là một sinh vật gọi là tinh linh và là nguyên nhân gây ra các đợt không gian chấn. Kotori cũng cho biết mình là một trong những lãnh đạo của tổ chức Ratatoskr, có nhiệm vụ ngăn chặn những hiểm họa tinh linh. Cô mời Shidou gia nhập tổ chức với nhiệm vụ phong ấn năng lượng của các tinh linh.
Điều kiện tiên quyết để hoàn thành nhiệm vụ này là Shidou phải hẹn hò với các cô gái và khiến họ yêu cậu. Cuộc hành trình của Shidou bắt đầu từ đây, khi cậu phải đối mặt với những thách thức và nguy hiểm để bảo vệ thế giới khỏi những hiểm họa tinh linh. Cậu sẽ phải sử dụng sự charm và tình cảm của mình để hoàn thành nhiệm vụ và cứu thế giới.